農業生物科技園區「亞太水族中心」已於西元二○一三年二月完工，秉持推動我國觀賞魚及其周邊產業的信念，特於飛宇樓三樓設置觀賞水族動物展示及交易中心，展示最具代表性之淡、海水觀賞魚（蝦）類品種，提供予園區水族業者展示空間，並配合國內外相關行銷活動，使園區內水族業者，有相互見習機會，讓台灣觀賞魚產業能不斷創新與永續發展。
水族展示廳主題有水晶蝦、金剛蝦、Pinto蝦、虎紋蝦、烤漆蝦、藍絲絨、黃米蝦、琉璃蝦、台灣原生蝦、淡水螯蝦、蘇拉維西蝦、海水觀賞蝦、淡水神仙魚、非洲慈鯛、古代魚、海水神仙魚、蝴蝶魚、隆頭魚、雀鯛、海葵魚、珊瑚、倒吊、海馬、有毒魚類、魨、鱟、海水魚種苗、彩虹魚、淡水魚種苗、金魚、淡水鱸魚、迷鰓魚、小型鯉科、鯰魚、大型加拉辛、南美異形魚、短鯛、鼠魚、七彩神仙魚、小型加拉辛、弱電魚、螢光魚、鰕虎、亞洲慈鯛、美洲慈鯛等多種淡海水觀賞魚蝦，共計61個水族缸。開館時間為星期三至星期一之上午上午9點至下午5點，星期二休館(如遇國定假日，照常開放)。為維護水族展示廳導覽觀賞品質，團體請主動聯繫並預約參訪時間(為方便作業建議至少提前一天)。